
近日,苏州医科师范大学第一次附属门诊门诊王学浩博士团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶点热量代谢率检测分析服务。
英语关键词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
简体中文主题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客人公司:南京医科大学
学习产品:细胞
拜谱带来了售后服务:转录组测序+蛋白质互作组+靶向疗法电能新陈代谢组
水平自驾路线:
探析成果
01、YBX1被鉴别为HCC中糖酵解的重要的染色体
本探索信息采集HCC肉瘤模板(n=7)的单体人体神经元RNA测序参数集进行分享,知道糖酵解亲水性首要网络化在肉瘤体人体神经元中,hdWGCNA分享掌握出9个表观遗传方案(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的求生活工作分享知道YBX1为独立自主求生活工作概率客观因素(图1H)。进一个步骤结合起来IHC、WB科学试验和肉瘤进行与附近非肉瘤进行的的空间转录组学参数集表明YBX1是肝体人体神经元癌的治疗的隐藏的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被选定为控制HCC神经细胞糖酵解的关健的因素
02、YBX1有利于促进HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗正能量代谢转化组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1根据并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1构建并推动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增进其磷过酸,才能提高网站其核转位
加大力度骤检查YBX1的O-GlcNAc糖基化能不危害其磷碱化,在OGT敲低的HCC人体细胞系中或用OGT调控剂OSMI-1工作,YBX1血清级别强势降底,YBX1磷碱化强势削减(图4A-C)。IP实验所显示信息,在一模一样的Flag-YBX1底物级别下,YBX1-WT的磷碱化级别强势远远超出YBX1-T57A,表示磷碱化的新增不只是仅是担心更快的YBX1血清把你想传达出来(图4D)。破乳了核和质混合物遇到TMG工作的HCC人体细胞系中YBX1核把你想传达出来的增高(图4E-F),加大力度骤遇到YBX1磷碱化的至关重要转换因素是AKT(图4G-I)。这种遇到认为O-GlcNAc糖基化完成带动其磷碱化来增加YBX1血清稳定性、可靠性、安全性等等处理高性并带动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖不有利其进那步会发生磷硝化作用掩盖并也能力促其核转位
05、YBX1可以淡化PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有利于促进PKM2转录
06、YBX1 也能加强组血清乳过酸修饰语水平面
探讨挖掘YBX1敲低重要下跌核蛋白质乳硝凝成用,更是是H3K18乳硝凝成用(图6A-C)。糖酵解可抑药品2-DG的实践断定了糖酵解与组核蛋白质乳硝凝成用的立即绑定qq,可能够抑制糖酵解可重要下跌H3K18la水平面(图6D)。PKM2过展现可逆反应转YBX1敲低引起的H3K18la下跌,到外源乳酸清理实际上提高自己H3K18la,还伴随着YBX1展现上浮,提示卡存在着同向反映(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la能够 丰度于YBX1重启子立即推进其转录,该整个过程受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),并挖掘P300 上浮是YBX1怎强H3K18乳酰凝成用的机理(图6K-L)。
图6.YBX1资料H3K18乳过酸淡化标准
内容总结
在这款深入分析中报道范文了YBX1在HCC中高抒发,还与糖酵解迷切涉及。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,可以动态平衡血清质并不断增加其抒发。这款淡化还增进YBX1在T57处的磷过酸,增进其核易位。对此,这种过程中 增加了糖酵解涉及表观遗传的转录并刺激作用乳酸的呈现。除此以外,YBX1激活开通P300的转录,转而动力组血清的乳过酸,尤其是是H3K18la,H3K18乳过酸正在向干预YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隔代遗传正反面馈环考核机制图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向药物正能量代谢转化组技术服务,拜谱生物学建立了完善成熟的转录组学、蛋清组学、全文翻译后淡化组学、基础代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
借鉴资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.