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网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿软件系统通较为常见的疾患组成。肾团队中CaOx尖晶石过达到饱和状态基性岩会以至于肾小管细胞膜直接损伤和凋亡,然而以至于肾结石的形成了。短链皮下油脂酸由肠内内厌氧发醇螨虫发醇营养膳食玻璃纤维产生了,不只是在高斯模糊肠内防线中推动用,另外在软件系统技术上也推动重要用。在这当中,丁酸是最充沛的短链皮下油脂酸,具备抗感染和免疫检测可抑制用,本的研究论述丁酸对CaOx肾结石的用非常内在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院口腔科泌尿美容外科吴忠硕士生导师、周子健博士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教导、周子健博士生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱菌物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网咯药学学安全服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

的文章种类:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 潜在客户基层单位:华山医生 论述人:大鼠、HK-2细胞核 排序个人信息:较组(Con)、模式化组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱提供数据科技:数据网络临床药理学检则

思绪工艺程序流程图

分析可是

调查人数首要创设大鼠建模 ,依据内分泌系统生物化学指数和组识病检学固色等调查的手段发现丁酸都可以提高CaOx建模 大鼠肾CaOx晶状体的建立和挫裂伤,缓解CaOx建模 大鼠的发炎挫裂伤和防腐蚀物的频繁表达方法。不仅,丁酸还可遏制草酸引导的HK-2组织挫裂伤、防腐蚀应激反应和组织凋亡。 为与探讨丁酸框架和靶DNA系统,的研究员从PubChem获利丁酸和丁酸酯的二维和二维框架(图1A)。经过PharmMapper数据资料显示信息库和Uniprot数据资料显示信息库治疗后共选择出115个丁酸靶DNA供进步骤解析。将DNA列表页倒入STRING数据资料显示信息库,做出PPI系统解析。Cytoscape列出了排顺的前20的联络线靶DNA的简略系统图,核心包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。哪些联络线DNA与系统中的其他的DNA均表演出一些的对应性,阐明哪些DNA应该起到着协同管理效用。GO和KEGG解析证明了丁酸联络线DNA的对应方法和生态学学基本功能(图1C)。联络线DNA核心与类固醇生长激素类回话、钝化应激的反应性回话、活力性酶类氧人体细胞对类固醇生长激素类的刺激的想法及对强酸有机化学有害物质的想法关干。上述讲到根据上述,哪些联络线DNA核心参予了钝化应激的反应性和对活力性酶类氧的生态学想法环节,是肾结石型成体系中至关根本的方法,这阐明丁酸应该在肾结石中起到根本效用。

图1| 丁酸型式与靶人类基因微信网络了解(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为提高认识骤找寻丁酸对CaOx肾结石更何况切靶人类表观遗传遗传,实验专业员工用GEO数据表格信息库对GSE73680中绿色健康照表与CaOx肾结石客户的人类表观遗传遗传性别差异使用了实验。照表组与CaOx结石客户的为明显性性别差异表示人类表观遗传遗传(DEGs)表观遗传检测的标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个人类表观遗传遗传时有发生为明显的变化,在当中3379个(89.4%)人类表观遗传遗传表示调整,404个(10.6%)人类表观遗传遗传表示调整(图2A)。对DEGs使用聚类分析法算法探讨,热图显视了前10个被选中DEGs的二维层次分割聚类分析法算法特殊性(图2B)。随即,实验专业员工能够 GeneCards数据表格信息库人造判定了370个应该与CaOx肾结石重要性的人类表观遗传遗传,自然排名前20位的预測人类表观遗传遗传和重要性性评定就像文中2C如下图所示。要想寻找丁酸治療CaOx肾结石的重要性靶点,实验专业员工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石重要性人类表观遗传遗传处理的一堆个Venn图。从而,CYP2C9被选定为丁酸印象CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。除此之外,实验专业员工还使用了丁酸与CYP2C9的原子项目对接,CYP2C9的5个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互为效果,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在根据网站药剂学学预測CYP2C9是丁酸反应CaOx肾结石的靶人类基因后,设计考生还根据组织组织细胞實驗证明了CYP2C9可降低了草酸帮助的HK-2组织组织细胞的ROS总体水平、真菌感染断裂和凋亡。

图2| 部分据库聯合阐述預测CYP2C9是丁酸效应于CaOx肾结石的靶染色体

研究探讨结杲

本探析一方面显示丁酸在休外和身体内均能遏制CaOx肾结石模式的氧化物物应激状态状态和真菌感染神经断裂,紧接着可以依据数据网洛药剂学学建立得出丁酸影向CaOx肾结石的潜在性靶点——CYP2C9,到最后可以依据受损体细胞研究可确认CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2受损体细胞ROS能力、真菌感染神经断裂和凋亡。这样的显示说明丁酸也许 可以依据遏制CYP2C9来遏制CaOx肾结石的氧化物物应激状态状态,缓解真菌感染神经断裂。这一种环节中拜谱生态学学能提供了数据网洛药剂学学能力精准业务,然而拜谱生态学学可提升 成熟期健全完善的什么是基因组学、蛋清质组学、基础代谢组学等多个学业务及能力精准业务,热情接待呼叫咨询公司! 参考使用医学文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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